Dans la réalisation des missions, l’ENAM travaille en partenariat avec des établissements similaires étrangers tels :

• l’Ecole d’Administration Publique de Québec (ENAP) pour une filière Management Public,
• le Centre d’Etudes Diplomatiques et Stratégiques de Paris (CEDS) pour une filière Relations Internationales,
• ou prochainement, l’Ecole Nationale d’Administration (ENA) de France pour des activités de recherche, de formations complémentaires spécialisées et de formations continues.

Quant à la réalisation des filières en cours de formation, l’Ecole bénéficie de l’appui de certaines institutions et organismes partenaires étarangers tels :

• le Campus Numérique Francophone Océan Indien
• la Fondation Friedrich Ebert
• le Programme des Nations Unies pour le développement (PNUD),
• la Banque Mondiale à travers le Projet de Gouvernance et de Développement Institutionnel (PGDI)
• la Coopération Francaise, filière Finances Publiques
• la Fondation de la Maison des Sciences de l’Homme
• l’Université Catholique de Louvain-La-Neuve (UCL)
• l'Agence Universitaire de la Francophonie (AUF)

Des partenaires de confiance de proximité :

L’Ecole travaille en étroite collaboration avec quelques établissements nationaux de formation . Par exemple, en cours de formation initiale, les élèves de l’ENAM suivent un stage militaire de courte durée à l’Academie Militaire d’Antsirabe.

D’autres organismes nationaux partenaires contribuent aussi à la bonne marche de l’école, certains peuvent même être associés pour des actions de sensibilisation visant, par exemple, à sensibiliser sur les thèmes de la transparence de gestion, la bonne gouvernance et la lutte contre la corruption.
Citons notamment :

• tous les Ministères et Institutions
• toutes les Représentations Diplomatiques
• le Conseil Supérieur de la Lutte contre la Corruption, le BIANCO
• la Chambre Nationale des Huissiers et Commissaires Priseurs
• la Société Publique Télécom Malagasy
• la Société Publique Paositra malagasy
• le Programme des Nations Unies pour le Développement
• le Zandarimariam-pirenena
• Saha de la coopération suisse
• BOA Madagascar
• Les Collectivités territoriales
• Les Organes de presse